Помогло следующее:
1.Полное удаление iTunes 10 (как удалить найдете здесь)
2.Перезагрузка.
3.Очистка реестра, например этим
4.Перезагрузка.
5.Установка iTunes 9
6.И не забыть включить средства Framework в панели управления средствами Windows.

Тунец запускаться не будет, по крайней мере у меня так, будет ругаться на какие то остатки в системе от более свежей версии (как исправить - без понятия). Но зато iFunBox наконец то заработает.
Иного пути, после продолжительных поисков и экспериментов я не нашел.