Вот кусок схемы касаемый джойста в jpeg.
Если все цепи целые и проверены, а джойстик после разборки сборки остался цел, как вы говорите - дальше идет D2000, а это проц.
Внимательно посмотрите еще, не закоротили ли нижний контакт джойста с экраном чипов.