По-барабану! Делай как удобно.
Потому что на аноде светодиода должен стоять резистор с меньшим сопротивлением, чем на катоде. В противном случае схема работать не будет.
Если внимательно присмотреться, то можно понять, что крокодил подключен к металлическому контакту на колодке кабеля 4-in-1 из комплекта SETool. В оригинале этого контакта и светодиода рядом с ним нет. Делаем вывод - автор конструкции впаял доработку в колодку кабеля 4-in-1. На корпус вывел светодиод и металлический контакт, на который выведено питание для иголки. А к проводу с иголкой для ТП припаял крокодил. Когда надо - прицепил, когда ненадо - отцепил.