Я для перепрошивки кпк и коммуникаторов указываю COM2. Схватывает на лету. Почему именно так не знаю. Я любитель. Если получится напиши, хочу развиваться дальше.
Посмотри в настройках ком2 и аналогично настрой Ком1 и он тоже будет схватывать на лету ..По умолчанию как правило стоят разные настройки ..